水滴能石穿的原因不止一种，有的是物理变化造成的，有的是化学变化造成的。
物理变化水滴石穿的一种原因是水从高处滴落，其冲击力比较大，冲击力给石头带来磨损，水滴日复一日、年复一年，一滴一磨，石头就被磨穿了。这一过程是物理变化，只是石头的形状发生了变化，没有产生新的物质。
化学变化水滴石穿的另一种原因是由于空气中含有的二氧化碳与水的共同作用。二氧化碳溶于水而生成碳酸，所以水滴实际上是具有弱酸性的碳酸溶液。当水滴落在石灰石、大理石这一类石块上时，碳酸就会与石块中的主要成分碳酸钙发生化学反应，生成能溶于水的碳酸氢钙，使石块局部缓慢溶解并流失。
化学方程式为：CaCO3+H20+C02=Ca(HCO3)2，所以为化学变化。
