是。氢键既可以存在于分子内也可以存在于分子间。氢键具有较高的选择性，不严格的饱和性和方向性；而分子间作用力不具有。在“折叠体化学”中，多氢键具有协同作用，诱导线性分子螺旋，而分子间作用力不具有协同效应。
分子间作用力指存在于分子与分子之间或惰性气体原子间的作用力，又称范德华力，具有加和性属于次级键。氢键、范德华力、盐键、疏水作用力、芳环堆积作用、卤键都属于次级键（又称分子间弱相互作用）。
氢键既可以是分子间氢键，也可以是分子内的。其键能最大约为200kJ/mol，一般为5-30kJ/mol，比一般的共价键、离子键和金属键键能要小，但强于静电引力。氢键对于生物高分子具有尤其重要的意义，它是蛋白质和核酸的二、三和四级结构得以稳定的部分原因。
